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发布日期:2024-02-24 01:27    点击次数:111
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砂仁是我国“四大南药”之一,具有化湿开胃、温脾止泻和理气安胎的功效,临床上主要用于诊疗胃肠谈疾病。砂仁中富含多种生物活性因素,包括蒸发性萜类、黄酮类和多糖类等化学因素,其中乙酸冰片酯、冰片、樟脑、柠檬烯和莰烯是主要蒸发性萜类。在《中国药典》中,正品砂仁有三栽植物开头,包括阳春砂Wurfbainia villosa、绿壳砂Wurfbainia villosa var. xanthioides和海南砂Wurfbainia longiligularis,其中阳春砂品性最佳,海南砂品性低于阳春砂,而绿壳砂主要在东南亚栽植。因此,对砂仁中蒸发性萜类生物合成进行盘考,领路不同植物开头蒸发性萜类各异的遗传基础,对砂仁品性擢升和遗传改进具有清苦酷爱酷爱。

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图1:A:海南砂;B:阳春砂

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近日,广州中医药大学岭南中药资源教授部重心执行室詹若挺/杨锦芬盘考员团队集聚湖南医药学院中药合成生物学盘考湖南省重心执行室黄雪霜诠释团队在Plant Physiology在线发表了题为“Comparison of Fructus Amomi genomes reveals the genetic basis of volatile terpenoids divergence and bornyl diphosphate synthase evolution”的盘考论文。该盘考拼装获取海南砂高质料染色体水平基因组,并与课题组前期拼装的阳春砂基因组进行比拟分析,领路两者蒸发性萜类各异的遗传基础,该盘考成果为过去通过基因工程手艺改进砂仁品性提供了清苦的基因资源。

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该盘考率先对海南砂和阳春砂不同组织部位中蒸发性萜类进行定性和定量分析,发现冰片基二磷酸(BPP)关连萜类(冰片、乙酸冰片酯和樟脑)在海南砂中多种组织均有漫步,而阳春砂中主要在种子团富集且含量较海南砂高。课题组前期对阳春砂中萜类合酶(WvTPS)的功能进行了系统盘考,轻松了阳春砂中惟一的冰片基二磷酸合酶(WvBPPS),且发现该基因在种子团中特异高抒发。为了领路海南砂和阳春砂蒸发性萜类各异的遗传基础,拼装获取了海南砂高质料染色体水平基因组(2.29 Gb, contig N50为80.39 Mb)。对海南砂中17个WlTPSs进行体外酶功能表征,轻松了WlBPPS和具有BPPS活性的WlTPS24/26/28,何况这些基因在多种组织均有抒发进而促进BPP关连萜类在海南砂多种组织漫步。酶能源学分析标明WlBPPS和WvBPPS的催化活性雷同,而qRT-PCR数据发现WvBPPS在种子团中的抒发水平显耀高于WlBPPS。进一步对WlBPPS和WvBPPS的运行子序列进行比对,发现WvBPPS运行子中具有调控胚乳特异性抒发的GCN4-motif元件,并通过转基因香烟考证GCN4-motif元件正向调控WvBPPS在种子中抒发,进而促进阳春砂种子团富含BPP关连萜类。此外,该盘考还对票据叶植物中TPS和BPPS的进化进行了盘考。

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总而言之,该盘考揭示了海南砂和阳春砂中蒸发性萜类各异的遗传基础,以及姜科中蒸发性萜类生物合成的进化,有助于过去砂仁品性的遗传改进。

图2:海南砂和阳春砂中主要TPS的关连性分析

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广州中医药大学博士生杨鹏、硕士凌旭怡和华南农业大学周筱帆诠释为该论文的共同第一作家,广州中医药大学杨锦芬盘考员、詹若挺盘考员和湖南医药学院黄雪霜诠释为该论文的共同通信作家。广州中医药大学马东明盘考员和华南植物园叶育石憨厚也参与了该项盘考。该盘考得到了国度当然科学基金、广东省重心研发忖度、广东南药产业手艺体系改进团队形势和中药合成生物学盘考湖南省重心执行室灵通课题等形势标资助。

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论文连结:

https://doi.org/10.1093/plphys/kiad400